Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms