Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms