Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms