Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX15Q9NRS6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms