Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GLB2Q9NR46 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms