Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms