Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms