Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms