Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms