Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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BPESC1Q9GZL8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BPESC1Q9GZL8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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