Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF1Q9BZW5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF1Q9BZW5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms