Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PCGF6Q9BYE7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms