Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC32Q9BV29 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms