Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms