Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms