Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms