Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms