Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms