Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms