Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms