Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS8Q99627 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms