Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms