Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms