Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms