Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms