Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms