Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms