Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms