Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms