Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms