Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2Q96I99 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms