Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A3Q96HJ5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms