Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM12Q96EX1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMIM12Q96EX1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMIM12Q96EX1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMIM12Q96EX1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMIM12Q96EX1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMIM12Q96EX1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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