Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms