Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC127Q96BQ5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC127Q96BQ5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms