Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms