Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms