Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms