Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms