Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms