Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms