Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP32Q8NFA0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms