Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms