Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSAMQ8N6F7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms