Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPUSD2Q8IZ73 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms