Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR6

CREBRF, CREB3 regulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBRFQ8IUR6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREBRFQ8IUR6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms