Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME9Q86XW9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME9Q86XW9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME9Q86XW9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NME9Q86XW9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NME9Q86XW9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NME9Q86XW9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NME9Q86XW9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NME9Q86XW9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NME9Q86XW9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NME9Q86XW9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME9Q86XW9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms