Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms