Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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