Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms